כנראה שזה בגלל...
שלתוכנות ישנות (שנכתבו עבור XP) יש מנהג לכתוב מידע (הגדרות, פלאגים וכו') לתקייה Program Files, שבVista היא נגישה רק מתוכנות שרצות עם הרשאות מלאות. במקרה שתוכנה שרצה בלי ההרשאות מנסה לפנות לשם, כמדומני שVista מנתב את המידע למקום אחר (לא בטוח איפה) וזה יכול לגרום לאי התאמות... בכל מקרה יש המון מידע על כל הבעיות בלינקים שסיפקתי.