יש בעיה בהגדרת תקופת בית שני
השם "תקופת בית שני" מטעה מעט. ניתן להבין ממנו שהתקופה מתחילה עם בניית בית שני ומסתיימת עם חורבן בית המקדש השני. בפועל, ההגדרה שונה. מרבית הההסטוריונים רואים את תחילת בית שני בראשית שיבת ציון (מיד לאחר הכרזת כורש, בשנת 538 לפנה"ס). ראוי לציין שבית המקדש עצמו לא נבנה מיד עם שיבת ציון. ע"פ ספר עזרא, נבנה המזבח והחלה עבודת ה' על הר הבית עוד לפני בניית המקדש. בניית הבית אומנם החלה בימי כורש, אך הופסקה בשל פעילות "צרי יהודה ובניימין" וחודשה רק בימי דריוש (שעלה לשלטון בשנת 520). בקשר לסיום התקופה, יש מחלוקת מסויימת: יש הרואים בחורבן ביהמ"ק בשנת 70 לספה"נ את סיום התקופה, ויש הרואים את סיום התקופה בדיכוי מרד בר כוכבא (בשנת 135 לסה"נ, דהיינו כ65 שנה לאחר חורבן הבית השני).
