זו בכלל לא בעיה.
היחידים שטוענים שמערות נטיפים הן בנות אלפי שנים בלבד הם בריאתנים, ואפילו מתוכם, מדובר בזן הזוי במיוחד שזכה לשם Young earth creationists.
יש סיבות טובות לכך שמדענים לא מתארכים נטיפים על פי האורך שלהם, אלא על פי תיארוך רדיומטרי (אורניום-תוריום).
מעבר לכך - התהליך שבו נוצרת המערה עצמה לוקח לא מעט זמן - ראה "היווצרות המערה" בויקי -
https://he.wikipedia.org/wiki/מערת_...A8.D7.95.D7.AA_.D7.94.D7.9E.D7.A2.D7.A8.D7.94 - שם מדובר על כך שהסלעים שבהם נוצרת המערה נוצרים בתהליך איטי כל כך שלוקח בערך 100 שנה לשכבה של סנטימטר להווצר. זה עוד לפני בכלל שתהליכים גיאו-טקטוניים הרימו את הסלעים הנ"ל אל מחוץ למים שבהם הם נוצרו. חשבת פעם כמה זמן לוקח ליצור הר?
רק אחרי שנוצר ההר (או גבעה, לצורך העניין), ונוצרת המערה עצמה, ונוצרים סדקים בגג המערה שמאפשרים למי גשמים לחלחל פנימה בקצב הנכון על מנת ליצור נטיפים - רק אז מתחילים הנטיפים להווצר. כך שגם אם הנטיפים הזקנים ביותר בעולם הם בני 5000 שנה,
הם מצביעים על עולם עתיק הרבה יותר מאשר אלפי שנים בודדות.
ובכל מקרה, גם אם אף מערות נטיפים בעולם כולו, כולל אלו שעדיין לא התגלו, לא עתיקה יותר מ 5000 שנה (וחלקן, לפחות, בהחלט עתיקות יותר), זה עדיין לא אומר כלום על גיל כדור הארץ (ובטח לא על גיל היקום, שהוא למעשה מה שמדברים עליו אותם הזויים) - בדיוק כמו שהעובדה שהשכן שלי נוהג ברכב משנת ייצור 2017 לא אומרת כלום על קיומם של רכבים לפני השנה הזו.