ציטוכרום C

[Escherichia Coli]

ציטוכרום C

אחד הדברים המגניבים לגבי ציטוכרום C זה שהוא מדד טוב למרחק אבולוציוני בין מינים שונים. אם זכרוני אינו מטעני - ההבדל ברצף חומצות האמינו של החלבון אצל בני-אדם לבין שמרים, למשל - הוא באיזור ה50 חומצות אמינו. השאלה היא - עד כמה ההבדל הזה משמעותי? ועוד דבר - כיצד ניתן לדעת לבטח ששינויים בסופו של דבר בקידודים של חלבונים לאורך תקופה מאוד ארוכה (שאכן בסופו של דבר גורמים לקידודו של חלבון עם אותה הפונקציה, אבל ניתן לקודד אותו בדרכים שונות לגמרי) - אכן נבעו משרשרת ארוכה של שינויים? אני שואל את זה בעיקר עבור מינים מאוד רחוקים אחד מהשני שלשניהם יש את הציטוכרום C - שכן מדובר כאן סה"כ בגן אחד שבמשך מיליוני השנים עבר המון מוטציות - או במילים פשוטות יותר : כיצד ניתן לדעת לבטח ש"יותר שינוי בציטוכרום C" = "מרחק גנאולוגי מהמין שיש בו את הציטוכרום C" - כביכול שאלה טריוויאלית , אבל אני שואל את זה בעיקר כי אני לא מבין הרבה בחלבונים :\ נ.ב - העובדה שניטרלו לחלוטין את החלק בגנום של השמרים שמקודד את הציטוכרום C שלהם והחליפו אותו אחד-לאחד בחלק בגנום *שלנו* והשמרים קודדו (!) ציטוכרום C פעיל ותקין לחלוטין => איך ניתן להסביר תופעה זו גנטית - וכיצד בדיוק העובדה הזו מחזקת את המוצא המשותף של הגן? (שוב, שאלות לכאורה טריוויאליות, אבל אני מעוניין בפרטים טכניים, ולא באינטואיציות שיש לי לגבי עובדות אלה)

 

[Wolverchenus]

אני חושב

שמאחר וכמו שציינת הציטוכרום C של כולם עושה את אותה פונקציה זה לא משנה מה הסינטקס של הפונקציה. הסיבה שהציטוכרום טוב לתיארוך אבולוציוני כנראה נובע מזה שהוא מאוד קדום ולכן נפוץ, לא שינה תפקוד והוא פשוט יחסית. ניסוי השמרים, אגב, קצת ידפוק גנטיקאים מולקולריים בעתיד שיגידו שיש דימיון מוזר בין שמרים מסוימים לבני אדם בציטוכרום C וזה מוכיח שאין אבולוציה ושפוסידון קיים אבל מילא P:

 

[Escherichia Coli]

אני מניח שהתלוצצת בנושא השמרים,

אני יכול לשער בנפשי כיצד הניסוי יחזק טיעונים אבולוציוניים - בסה"כ מדובר בגרסה "שונה" של גן קדמון, שהיא עדיין שימושית וניתן עדיין לאורגניזם אחר לקודד חלבון שיעבוד בצורה תקינה. השאלה היא אם זה ההסבר היחידי שיכול להיות לתופעה זו. אני העליתי את השאלה משום שאני די בור בנושא של החלבון הספציפי הזה (כל מה שאני יודע זה שהוא משתתף חשוב בתהליך הגליקוליזה, שאת זה אתה בטח מכיר, וליתר דיוק - לפוספורוליזציה של הגלוקוז, אבל לא משנה, הפרטים לא משנים כרגע) - וסיבה זו קצת קשה לי לשער בנפשי כיצד אפשר להיות כל-כך סמוכים ובטוחים שהגן של החלבון הנ"ל הוא אכן אותו הגן מה שהיה מניח את דעתי, נגיד - זה אם מישהו שמבין בזה היה מראה לי את הsequence של החלבונים ומראה לי אתרים של אינוורציות או החסרים וכן-הלאה, ומראה שזה עולה בקנה-אחד עם לוח-השנה האבולוציוני.. אם אכן זה כך - אז מאוד מאוד קשה להסביר בדרך אחרת (מלבד דרך ניסים) את זה שממש לפי העץ הפילוגנטי - יש לך גן לצ'4 שהוא זהה לחלוטין בין מינים קרובים ושונה בהתאם למרחק בין המינים.