בתקופת רבי עקיבא (100 לספירה)
נקבע סדר הספרים הנוכחי (אחרי שהוא אישר את צירוף שיר-השירים). זהו 'נוסח המסורה' שנחשב לקאנוני, וששרד בעיקר בכתבי היד הטבריאניים מהמאה העשירית. קיימים בנוסף גם נוסח 'תרגום השבעים' של התנ"ך ליוונית במצרים (בערך 100 לפני הספירה ויותר), שכולל סדר שונה וכן גירסה שונה לספר יהושוע. הנוסח הזה שימש את הנוצרים לא מעט. נוסח שלישי הוא 'תנ"ך השומרונים', שכנראה נקבע גם באותה תקופה. במגילות ים המלח נמצאו עוד כמה וריאציות, שכולם נובעים ממקור אחד - העריכה של עזרא הסופר מ-300 לפני הספירה.