במכת חום- מדידת חום רקטלית נחשבת אמינה יותר ומהווה קירוב טוב יותר לטמפרטורת ה"ליבה" של הגוף ולכן משתמשים בה כאשר יש חשד לפגיעה ממכת חום או מהיפותרמייה. סיבה חשובה נוספת היא שבד"כ נפגע הסובל ממכת חום לא יהיה במצב שיאפשר מדידה אוראלית (מעורפל). ולכן מדידת חום רקטלית נחשבת כסטנדרט טיפולי במקרה של חשד למכת חום. השימוש בה תלוי בנהלים המקומיים של הארגון שמטעמו אתה פועל. ובכל זאת, כנראה שלא מדובר על אמת מוחלטת: " Newsham et al (1) effectively demonstrated significant rectal temperature lag during controlled exertional hyperthermia, particularly during the recovery phase. As a result, they rightfully questioned the position of the American College of Sports Medicine regarding sole reliance on rectal temperature measurements during the evaluation and treatment of patients with heat-related injuries " Comparison of rectal and tympanic thermometry during exercise. (Letters to the Editor) Southern Medical Journal / March 01, 2003 וכאן.