יש חפיפה בין התחומים
יש חפיפה בין התחומים, אפשר להגיד שניהול פרויקטים (קצין פרויקטים whatever) זה תחום בתוך הנדסת מערכת. ניהול פרויקטים זה ברמה של קורס או הסמכה בעוד שהנדסת מערכת יכול להיות אף תואר שלם - מה שמעיד על היקף התחום.
 
המיקוד גם מעט שונה:
בניהול פרויקטים יש לך יעד ברור (זמן, עלות, איכות) והמיקוד הוא בהשלמת הפרויקט.
בהנדסת מערכת הפרויקט הוא המוצר ולכן דרושה הבנה במורכבות הפנימית של המערכת ותהליך הפיתוח.
 
עכשיו שים לב שאני מסבן אותך - בצה״ל אתה יכול להיות מוגדר קצין פרויקט של מערכת מידע (למשל) ותהיה אחראי על איפיון הצרכים, תיעדוף תכולות, תקציב וכו׳... אתה מהנדס מערכת או קצין פרויקט? יש הרבה תפקידים שניתן להשתמש בשתי ההגדרות באופן חליפי.
 
ממליץ בחום לחפש באינטרנט משרות בכל אחד מהתפקידים ותראה שהדרישות ותחומי האחריות לא כל כך שונים!
 
ואם אתה שואל בשביל להחליט בין שני תפקידים שהציעו לך בצבא אל תשפוט לפי השם - אנשים קובעים את טייטל התפקיד כדי שיהיה יותר אטרקטיבי. תשאל את מי שמראיין אותך מה התפקיד בדיוק כולל - אל תקנה חתול בשק.
 
ולסיום, כמו לכל עתודאי אני ממליץ לך בחום לבדוק את האתר atudaim.org.il (לאו דווקא בהקשר שאלתך)